Pada 15 Oktober 2008, Menteri Dalam Negeri Datuk Seri Syed Hamid Albar mengisytiharkan pengharaman Hindraf kerana fakta dan bukti menunjukkan Hindraf telah dan sedang digunakan bagi maksud memudaratkan ketenteraman awam , keselamatan negara, kedaulatan negara malah menjejaskan keharmonian hidup masyarakat majmuk di Malaysia. Hindraf bertentangan dengan Sekyen 5(1) dan Akta Pertubuhan 1966 (Akta 335).Barisan peguam dari Hindraf pernah mohon pendaftaran sebagai pertubuhan pada 16 Oktober 2007 tetapi pihak pendaftar mengambil masa lama untuk meluluskannya . Menjadi tanggungjawab Jabatan Pertubuhan untuk menyiasat latar belakang organisasi , objektif tersurat dan tersirat , kelayakan individu serta kecenderungan mereka.

Walaupun belum didaftarkan tetapi Hindraf aktif menganjurkan perhimpunan awam dan demontrasi tanpa permit dan mengeksplotasi isu-isu perkauman sehingga mencetuskan kebencian di antara orang-orang Melayu dan India di negara ini.Mslah meminta negara asing menekan Malaysia hingga menjejaskan imej negara.[22]

Pada 16 Oktober 2008, Suruhanjaya Hak Asasi Manusia Malaysia (Suhakam) berpendapat tindakan pentgharaman Hindraf merupakan tindakan pencabulan hak berpersatuan yang menjadi asas hak asasi manusia. Tan Sri Simon Sipaun, Datuk Dr Michael Yeoh Oon Kheng dan Datuk Dr Denison Jayasooria berkata tindakan ini akan menyisihkan pergerakan sosial berkenaan daripada masyarakat arus perdana. Tindakan ini tidak akan menyelesaikan isu-isu yang diperjuangkan kumpulan dan individu pergerakan itu [23] Secara teknikal, Hindraf sebuah pertubuhan yang tidak wujud dari segi perundangan dan organisasinya belum didaftarkan secara rasmi.